Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col8a1Q00780 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col8a1Q00780 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms