Protein–RNA interactions for Protein: P97817

Cdr2, Cerebellar degeneration-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2P97817 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdr2P97817 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdr2P97817 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdr2P97817 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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