Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Smarcc1P97496 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarcc1P97496 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms