Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otx2P80206 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otx2P80206 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otx2P80206 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otx2P80206 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otx2P80206 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otx2P80206 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Otx2P80206 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otx2P80206 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otx2P80206 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otx2P80206 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Otx2P80206 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otx2P80206 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Otx2P80206 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms