Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad50P70388 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rad50P70388 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rad50P70388 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rad50P70388 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad50P70388 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad50P70388 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad50P70388 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rad50P70388 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rad50P70388 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rad50P70388 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad50P70388 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad50P70388 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms