Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprvP70289 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprvP70289 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprvP70289 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprvP70289 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprvP70289 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PtprvP70289 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprvP70289 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprvP70289 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprvP70289 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprvP70289 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprvP70289 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms