Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Surf6P70279 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf6P70279 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf6P70279 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Surf6P70279 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Surf6P70279 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Surf6P70279 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf6P70279 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Surf6P70279 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Surf6P70279 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms