Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf5P70191 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf5P70191 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf5P70191 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf5P70191 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Traf5P70191 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Traf5P70191 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf5P70191 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf5P70191 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf5P70191 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf5P70191 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf5P70191 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms