Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabrb3P63080 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabrb3P63080 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabrb3P63080 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabrb3P63080 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabrb3P63080 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabrb3P63080 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gabrb3P63080 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabrb3P63080 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms