Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ElobP62869 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ElobP62869 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ElobP62869 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ElobP62869 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ElobP62869 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ElobP62869 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ElobP62869 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ElobP62869 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ElobP62869 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ElobP62869 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ElobP62869 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ElobP62869 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ElobP62869 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ElobP62869 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ElobP62869 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ElobP62869 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ElobP62869 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ElobP62869 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ElobP62869 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ElobP62869 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ElobP62869 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ElobP62869 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ElobP62869 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ElobP62869 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ElobP62869 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ElobP62869 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ElobP62869 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ElobP62869 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ElobP62869 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ElobP62869 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ElobP62869 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ElobP62869 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ElobP62869 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ElobP62869 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ElobP62869 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ElobP62869 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ElobP62869 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ElobP62869 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ElobP62869 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ElobP62869 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ElobP62869 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ElobP62869 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ElobP62869 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ElobP62869 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ElobP62869 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ElobP62869 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ElobP62869 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ElobP62869 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ElobP62869 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ElobP62869 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ElobP62869 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ElobP62869 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ElobP62869 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ElobP62869 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ElobP62869 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ElobP62869 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ElobP62869 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ElobP62869 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ElobP62869 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ElobP62869 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ElobP62869 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ElobP62869 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ElobP62869 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ElobP62869 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ElobP62869 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ElobP62869 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ElobP62869 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ElobP62869 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ElobP62869 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ElobP62869 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ElobP62869 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ElobP62869 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ElobP62869 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ElobP62869 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ElobP62869 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ElobP62869 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ElobP62869 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ElobP62869 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ElobP62869 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ElobP62869 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ElobP62869 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ElobP62869 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ElobP62869 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ElobP62869 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ElobP62869 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ElobP62869 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ElobP62869 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ElobP62869 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ElobP62869 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ElobP62869 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ElobP62869 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ElobP62869 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ElobP62869 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ElobP62869 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ElobP62869 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ElobP62869 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ElobP62869 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ElobP62869 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ElobP62869 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms