Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms