Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vsnl1P62761 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vsnl1P62761 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vsnl1P62761 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vsnl1P62761 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vsnl1P62761 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms