Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms