Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dpf3P58269 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms