Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actn4P57780 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actn4P57780 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actn4P57780 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actn4P57780 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn4P57780 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn4P57780 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn4P57780 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn4P57780 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn4P57780 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn4P57780 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Actn4P57780 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn4P57780 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn4P57780 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms