Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sssca1P56873 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sssca1P56873 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sssca1P56873 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms