Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pdcd5P56812 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pdcd5P56812 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pdcd5P56812 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pdcd5P56812 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pdcd5P56812 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pdcd5P56812 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pdcd5P56812 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms