Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TdgP56581 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TdgP56581 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TdgP56581 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TdgP56581 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TdgP56581 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TdgP56581 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TdgP56581 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TdgP56581 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TdgP56581 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TdgP56581 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TdgP56581 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TdgP56581 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TdgP56581 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TdgP56581 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TdgP56581 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TdgP56581 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TdgP56581 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TdgP56581 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TdgP56581 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TdgP56581 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TdgP56581 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TdgP56581 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TdgP56581 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TdgP56581 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TdgP56581 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TdgP56581 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TdgP56581 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TdgP56581 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TdgP56581 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TdgP56581 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TdgP56581 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TdgP56581 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TdgP56581 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TdgP56581 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TdgP56581 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TdgP56581 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TdgP56581 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TdgP56581 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TdgP56581 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TdgP56581 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TdgP56581 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TdgP56581 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TdgP56581 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TdgP56581 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TdgP56581 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TdgP56581 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TdgP56581 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TdgP56581 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TdgP56581 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TdgP56581 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TdgP56581 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TdgP56581 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TdgP56581 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TdgP56581 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TdgP56581 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TdgP56581 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TdgP56581 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TdgP56581 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TdgP56581 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TdgP56581 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TdgP56581 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TdgP56581 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TdgP56581 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TdgP56581 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TdgP56581 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TdgP56581 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TdgP56581 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TdgP56581 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TdgP56581 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TdgP56581 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TdgP56581 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TdgP56581 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TdgP56581 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TdgP56581 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TdgP56581 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TdgP56581 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TdgP56581 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TdgP56581 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TdgP56581 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TdgP56581 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TdgP56581 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TdgP56581 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TdgP56581 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TdgP56581 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TdgP56581 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TdgP56581 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TdgP56581 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TdgP56581 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TdgP56581 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TdgP56581 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TdgP56581 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TdgP56581 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TdgP56581 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TdgP56581 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TdgP56581 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TdgP56581 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TdgP56581 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TdgP56581 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TdgP56581 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms