Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd38P56528 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd38P56528 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd38P56528 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd38P56528 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd38P56528 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd38P56528 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd38P56528 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd38P56528 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cd38P56528 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cd38P56528 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd38P56528 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd38P56528 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd38P56528 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms