Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GferP56213 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GferP56213 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GferP56213 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GferP56213 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GferP56213 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GferP56213 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GferP56213 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GferP56213 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GferP56213 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GferP56213 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GferP56213 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GferP56213 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GferP56213 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GferP56213 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GferP56213 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GferP56213 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GferP56213 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GferP56213 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GferP56213 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GferP56213 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GferP56213 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GferP56213 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GferP56213 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GferP56213 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GferP56213 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GferP56213 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GferP56213 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GferP56213 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GferP56213 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GferP56213 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GferP56213 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GferP56213 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GferP56213 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GferP56213 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GferP56213 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GferP56213 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GferP56213 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GferP56213 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GferP56213 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GferP56213 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GferP56213 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GferP56213 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GferP56213 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GferP56213 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GferP56213 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GferP56213 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GferP56213 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GferP56213 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GferP56213 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GferP56213 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GferP56213 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GferP56213 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GferP56213 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GferP56213 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GferP56213 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GferP56213 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GferP56213 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GferP56213 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GferP56213 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GferP56213 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GferP56213 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GferP56213 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GferP56213 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GferP56213 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GferP56213 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GferP56213 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GferP56213 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GferP56213 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GferP56213 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GferP56213 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GferP56213 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GferP56213 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GferP56213 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GferP56213 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GferP56213 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GferP56213 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GferP56213 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GferP56213 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GferP56213 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GferP56213 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GferP56213 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GferP56213 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GferP56213 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GferP56213 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GferP56213 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GferP56213 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GferP56213 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GferP56213 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GferP56213 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GferP56213 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GferP56213 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GferP56213 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GferP56213 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GferP56213 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GferP56213 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GferP56213 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GferP56213 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GferP56213 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GferP56213 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms