Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rad23bP54728 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rad23bP54728 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.2 ms