Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pold1P52431 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pold1P52431 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pold1P52431 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pold1P52431 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pold1P52431 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pold1P52431 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pold1P52431 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pold1P52431 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pold1P52431 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pold1P52431 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold1P52431 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold1P52431 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold1P52431 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold1P52431 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 452.3 ms