Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cxcl5P50228 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcl5P50228 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl5P50228 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms