Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkn1cP49919 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkn1cP49919 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkn1cP49919 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms