Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CitP49025 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CitP49025 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CitP49025 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CitP49025 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CitP49025 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CitP49025 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CitP49025 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CitP49025 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CitP49025 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CitP49025 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CitP49025 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CitP49025 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CitP49025 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CitP49025 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CitP49025 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CitP49025 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CitP49025 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CitP49025 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CitP49025 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CitP49025 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CitP49025 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CitP49025 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CitP49025 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CitP49025 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CitP49025 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CitP49025 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CitP49025 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CitP49025 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CitP49025 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CitP49025 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CitP49025 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CitP49025 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CitP49025 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CitP49025 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CitP49025 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CitP49025 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CitP49025 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CitP49025 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CitP49025 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CitP49025 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CitP49025 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CitP49025 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CitP49025 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CitP49025 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CitP49025 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CitP49025 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CitP49025 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CitP49025 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CitP49025 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CitP49025 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CitP49025 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CitP49025 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CitP49025 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CitP49025 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CitP49025 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CitP49025 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CitP49025 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CitP49025 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CitP49025 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CitP49025 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CitP49025 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CitP49025 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CitP49025 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CitP49025 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CitP49025 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CitP49025 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CitP49025 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CitP49025 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CitP49025 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CitP49025 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CitP49025 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CitP49025 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CitP49025 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CitP49025 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CitP49025 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CitP49025 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CitP49025 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CitP49025 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CitP49025 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CitP49025 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CitP49025 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CitP49025 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CitP49025 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CitP49025 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CitP49025 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CitP49025 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CitP49025 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CitP49025 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CitP49025 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CitP49025 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CitP49025 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CitP49025 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CitP49025 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CitP49025 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CitP49025 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CitP49025 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CitP49025 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CitP49025 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CitP49025 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms