Protein–RNA interactions for Protein: P46460

Nsf, Vesicle-fusing ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsfP46460 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NsfP46460 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NsfP46460 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NsfP46460 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NsfP46460 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NsfP46460 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NsfP46460 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NsfP46460 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NsfP46460 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NsfP46460 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NsfP46460 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NsfP46460 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NsfP46460 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NsfP46460 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NsfP46460 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NsfP46460 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NsfP46460 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NsfP46460 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NsfP46460 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NsfP46460 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NsfP46460 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NsfP46460 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NsfP46460 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NsfP46460 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NsfP46460 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NsfP46460 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NsfP46460 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NsfP46460 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NsfP46460 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NsfP46460 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NsfP46460 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NsfP46460 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NsfP46460 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NsfP46460 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NsfP46460 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NsfP46460 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NsfP46460 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NsfP46460 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NsfP46460 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NsfP46460 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NsfP46460 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NsfP46460 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NsfP46460 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NsfP46460 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NsfP46460 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NsfP46460 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NsfP46460 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NsfP46460 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NsfP46460 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NsfP46460 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NsfP46460 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NsfP46460 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NsfP46460 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NsfP46460 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NsfP46460 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NsfP46460 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NsfP46460 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NsfP46460 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NsfP46460 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NsfP46460 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NsfP46460 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NsfP46460 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NsfP46460 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NsfP46460 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NsfP46460 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NsfP46460 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NsfP46460 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NsfP46460 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NsfP46460 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NsfP46460 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NsfP46460 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NsfP46460 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NsfP46460 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NsfP46460 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NsfP46460 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NsfP46460 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NsfP46460 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NsfP46460 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsfP46460 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NsfP46460 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsfP46460 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsfP46460 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsfP46460 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsfP46460 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsfP46460 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NsfP46460 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NsfP46460 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NsfP46460 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NsfP46460 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NsfP46460 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NsfP46460 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NsfP46460 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NsfP46460 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NsfP46460 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NsfP46460 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NsfP46460 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NsfP46460 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NsfP46460 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NsfP46460 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NsfP46460 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms