Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsf4P43488 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfsf4P43488 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms