Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ItgavP43406 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ItgavP43406 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ItgavP43406 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ItgavP43406 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ItgavP43406 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ItgavP43406 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ItgavP43406 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ItgavP43406 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ItgavP43406 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ItgavP43406 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ItgavP43406 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ItgavP43406 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ItgavP43406 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ItgavP43406 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ItgavP43406 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ItgavP43406 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ItgavP43406 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ItgavP43406 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ItgavP43406 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ItgavP43406 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ItgavP43406 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgavP43406 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ItgavP43406 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgavP43406 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgavP43406 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgavP43406 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ItgavP43406 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms