Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtgfrP43117 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms