Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lig1P37913 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lig1P37913 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lig1P37913 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lig1P37913 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lig1P37913 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lig1P37913 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lig1P37913 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lig1P37913 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lig1P37913 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lig1P37913 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lig1P37913 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lig1P37913 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lig1P37913 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lig1P37913 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms