Protein–RNA interactions for Protein: P35846

Folr1, Folate receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Folr1P35846 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Folr1P35846 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Folr1P35846 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Folr1P35846 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Folr1P35846 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Folr1P35846 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Folr1P35846 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Folr1P35846 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Folr1P35846 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Folr1P35846 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Folr1P35846 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms