Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PtprkP35822 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PtprkP35822 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PtprkP35822 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PtprkP35822 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PtprkP35822 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PtprkP35822 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PtprkP35822 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PtprkP35822 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PtprkP35822 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PtprkP35822 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PtprkP35822 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PtprkP35822 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PtprkP35822 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PtprkP35822 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PtprkP35822 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PtprkP35822 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PtprkP35822 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PtprkP35822 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PtprkP35822 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PtprkP35822 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PtprkP35822 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PtprkP35822 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PtprkP35822 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PtprkP35822 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PtprkP35822 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PtprkP35822 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PtprkP35822 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PtprkP35822 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PtprkP35822 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
PtprkP35822 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PtprkP35822 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PtprkP35822 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PtprkP35822 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms