Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoc3P33622 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apoc3P33622 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apoc3P33622 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms