Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd28P31041 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd28P31041 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd28P31041 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd28P31041 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd28P31041 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd28P31041 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd28P31041 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd28P31041 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd28P31041 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd28P31041 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms