Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vcam1P29533 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vcam1P29533 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vcam1P29533 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms