Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkcdP28867 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcdP28867 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms