Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RxraP28700 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RxraP28700 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RxraP28700 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RxraP28700 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RxraP28700 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RxraP28700 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RxraP28700 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RxraP28700 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RxraP28700 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RxraP28700 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RxraP28700 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RxraP28700 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RxraP28700 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RxraP28700 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RxraP28700 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RxraP28700 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RxraP28700 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RxraP28700 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RxraP28700 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RxraP28700 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RxraP28700 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RxraP28700 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RxraP28700 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RxraP28700 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RxraP28700 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RxraP28700 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RxraP28700 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RxraP28700 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RxraP28700 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RxraP28700 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RxraP28700 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RxraP28700 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RxraP28700 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RxraP28700 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RxraP28700 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RxraP28700 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RxraP28700 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RxraP28700 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RxraP28700 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RxraP28700 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RxraP28700 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RxraP28700 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RxraP28700 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RxraP28700 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RxraP28700 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RxraP28700 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RxraP28700 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RxraP28700 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RxraP28700 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RxraP28700 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RxraP28700 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RxraP28700 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RxraP28700 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RxraP28700 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RxraP28700 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RxraP28700 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RxraP28700 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RxraP28700 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RxraP28700 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RxraP28700 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RxraP28700 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RxraP28700 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RxraP28700 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RxraP28700 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RxraP28700 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RxraP28700 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RxraP28700 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RxraP28700 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RxraP28700 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RxraP28700 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RxraP28700 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RxraP28700 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RxraP28700 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RxraP28700 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RxraP28700 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RxraP28700 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RxraP28700 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RxraP28700 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RxraP28700 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RxraP28700 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RxraP28700 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RxraP28700 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RxraP28700 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RxraP28700 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RxraP28700 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RxraP28700 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RxraP28700 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RxraP28700 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RxraP28700 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RxraP28700 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RxraP28700 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RxraP28700 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RxraP28700 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RxraP28700 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RxraP28700 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RxraP28700 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RxraP28700 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RxraP28700 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RxraP28700 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms