Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Marcksl1P28667 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Marcksl1P28667 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Marcksl1P28667 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Marcksl1P28667 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Marcksl1P28667 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Marcksl1P28667 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Marcksl1P28667 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Marcksl1P28667 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Marcksl1P28667 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Marcksl1P28667 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms