Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lef1P27782 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lef1P27782 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lef1P27782 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lef1P27782 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lef1P27782 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lef1P27782 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lef1P27782 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lef1P27782 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lef1P27782 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lef1P27782 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lef1P27782 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lef1P27782 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lef1P27782 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lef1P27782 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lef1P27782 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms