Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CftrP26361 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
CftrP26361 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CftrP26361 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CftrP26361 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
CftrP26361 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CftrP26361 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CftrP26361 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CftrP26361 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CftrP26361 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CftrP26361 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CftrP26361 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CftrP26361 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CftrP26361 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CftrP26361 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
CftrP26361 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CftrP26361 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CftrP26361 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CftrP26361 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CftrP26361 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
CftrP26361 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CftrP26361 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CftrP26361 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CftrP26361 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CftrP26361 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CftrP26361 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CftrP26361 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CftrP26361 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CftrP26361 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CftrP26361 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CftrP26361 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CftrP26361 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CftrP26361 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CftrP26361 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CftrP26361 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CftrP26361 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CftrP26361 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CftrP26361 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CftrP26361 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CftrP26361 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CftrP26361 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CftrP26361 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CftrP26361 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CftrP26361 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CftrP26361 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CftrP26361 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CftrP26361 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CftrP26361 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CftrP26361 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CftrP26361 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CftrP26361 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CftrP26361 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CftrP26361 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CftrP26361 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CftrP26361 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CftrP26361 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CftrP26361 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CftrP26361 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CftrP26361 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CftrP26361 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CftrP26361 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CftrP26361 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CftrP26361 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CftrP26361 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CftrP26361 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CftrP26361 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CftrP26361 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CftrP26361 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CftrP26361 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CftrP26361 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CftrP26361 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CftrP26361 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CftrP26361 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CftrP26361 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CftrP26361 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CftrP26361 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CftrP26361 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CftrP26361 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CftrP26361 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CftrP26361 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CftrP26361 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CftrP26361 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CftrP26361 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CftrP26361 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CftrP26361 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CftrP26361 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
CftrP26361 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CftrP26361 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CftrP26361 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CftrP26361 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CftrP26361 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CftrP26361 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CftrP26361 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
CftrP26361 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CftrP26361 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CftrP26361 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CftrP26361 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CftrP26361 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CftrP26361 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CftrP26361 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms