Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd247P24161 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd247P24161 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd247P24161 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd247P24161 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd247P24161 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd247P24161 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd247P24161 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd247P24161 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd247P24161 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd247P24161 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd247P24161 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd247P24161 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cd247P24161 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd247P24161 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cd247P24161 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd247P24161 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd247P24161 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd247P24161 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd247P24161 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd247P24161 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd247P24161 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd247P24161 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd247P24161 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd247P24161 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd247P24161 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd247P24161 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd247P24161 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd247P24161 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd247P24161 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd247P24161 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms