Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfyaP23708 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfyaP23708 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfyaP23708 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfyaP23708 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NfyaP23708 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfyaP23708 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfyaP23708 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfyaP23708 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NfyaP23708 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfyaP23708 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NfyaP23708 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfyaP23708 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfyaP23708 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms