Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ifrd1P19182 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms