Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18527 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18527 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18527 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P18527 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18527 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18527 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18527 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18527 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18527 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18527 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18527 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18527 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18527 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18527 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18527 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18527 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18527 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18527 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P18527 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18527 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18527 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18527 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18527 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18527 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18527 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18527 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18527 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18527 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18527 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18527 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18527 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18527 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18527 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18527 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18527 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18527 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18527 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18527 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18527 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18527 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18527 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P18527 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18527 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18527 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18527 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18527 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18527 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18527 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18527 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18527 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18527 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18527 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18527 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18527 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18527 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18527 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18527 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18527 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18527 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18527 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18527 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18527 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P18527 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18527 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18527 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18527 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18527 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18527 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18527 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P18527 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18527 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P18527 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18527 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18527 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18527 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18527 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18527 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18527 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms