Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cxcl1P12850 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl1P12850 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms