Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OtcP11725 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
OtcP11725 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OtcP11725 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OtcP11725 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OtcP11725 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OtcP11725 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OtcP11725 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OtcP11725 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OtcP11725 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtcP11725 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtcP11725 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtcP11725 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtcP11725 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtcP11725 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtcP11725 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
OtcP11725 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtcP11725 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtcP11725 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtcP11725 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OtcP11725 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OtcP11725 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OtcP11725 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OtcP11725 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OtcP11725 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OtcP11725 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OtcP11725 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OtcP11725 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OtcP11725 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OtcP11725 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OtcP11725 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OtcP11725 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OtcP11725 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OtcP11725 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OtcP11725 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OtcP11725 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OtcP11725 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OtcP11725 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OtcP11725 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OtcP11725 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OtcP11725 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OtcP11725 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OtcP11725 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OtcP11725 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OtcP11725 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OtcP11725 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OtcP11725 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
OtcP11725 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
OtcP11725 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OtcP11725 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OtcP11725 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OtcP11725 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OtcP11725 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OtcP11725 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OtcP11725 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OtcP11725 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OtcP11725 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OtcP11725 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OtcP11725 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OtcP11725 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OtcP11725 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OtcP11725 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OtcP11725 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OtcP11725 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OtcP11725 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OtcP11725 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OtcP11725 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OtcP11725 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OtcP11725 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OtcP11725 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtcP11725 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtcP11725 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtcP11725 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtcP11725 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtcP11725 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtcP11725 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtcP11725 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtcP11725 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtcP11725 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtcP11725 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OtcP11725 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OtcP11725 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OtcP11725 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OtcP11725 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OtcP11725 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OtcP11725 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OtcP11725 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
OtcP11725 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OtcP11725 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OtcP11725 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OtcP11725 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OtcP11725 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OtcP11725 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OtcP11725 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OtcP11725 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OtcP11725 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OtcP11725 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OtcP11725 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
OtcP11725 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OtcP11725 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms