Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt8P11679 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt8P11679 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt8P11679 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt8P11679 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt8P11679 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt8P11679 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt8P11679 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt8P11679 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt8P11679 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt8P11679 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt8P11679 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt8P11679 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt8P11679 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt8P11679 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt8P11679 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt8P11679 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt8P11679 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt8P11679 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt8P11679 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt8P11679 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt8P11679 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt8P11679 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt8P11679 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt8P11679 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt8P11679 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt8P11679 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt8P11679 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Krt8P11679 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt8P11679 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt8P11679 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt8P11679 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt8P11679 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt8P11679 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt8P11679 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt8P11679 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt8P11679 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt8P11679 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt8P11679 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt8P11679 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt8P11679 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt8P11679 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt8P11679 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt8P11679 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt8P11679 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt8P11679 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt8P11679 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt8P11679 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt8P11679 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt8P11679 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt8P11679 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt8P11679 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt8P11679 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Krt8P11679 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt8P11679 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt8P11679 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt8P11679 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Krt8P11679 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt8P11679 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt8P11679 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt8P11679 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt8P11679 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt8P11679 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt8P11679 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt8P11679 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt8P11679 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt8P11679 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt8P11679 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms