Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifna9P09235 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifna9P09235 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms