Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax1P09084 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax1P09084 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax1P09084 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax1P09084 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax1P09084 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax1P09084 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax1P09084 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax1P09084 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms