Protein–RNA interactions for Protein: P06879

Prl, Prolactin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlP06879 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrlP06879 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrlP06879 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrlP06879 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrlP06879 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrlP06879 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrlP06879 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrlP06879 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrlP06879 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrlP06879 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrlP06879 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrlP06879 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrlP06879 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrlP06879 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrlP06879 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrlP06879 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrlP06879 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrlP06879 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrlP06879 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PrlP06879 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrlP06879 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrlP06879 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrlP06879 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrlP06879 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrlP06879 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrlP06879 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrlP06879 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrlP06879 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrlP06879 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrlP06879 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrlP06879 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrlP06879 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrlP06879 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrlP06879 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrlP06879 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrlP06879 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrlP06879 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrlP06879 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrlP06879 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrlP06879 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrlP06879 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrlP06879 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrlP06879 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrlP06879 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrlP06879 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrlP06879 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrlP06879 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrlP06879 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrlP06879 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrlP06879 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrlP06879 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrlP06879 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrlP06879 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrlP06879 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrlP06879 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrlP06879 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrlP06879 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PrlP06879 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrlP06879 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrlP06879 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrlP06879 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrlP06879 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrlP06879 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PrlP06879 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrlP06879 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrlP06879 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrlP06879 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrlP06879 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrlP06879 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrlP06879 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrlP06879 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrlP06879 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrlP06879 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrlP06879 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PrlP06879 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrlP06879 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrlP06879 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrlP06879 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrlP06879 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrlP06879 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrlP06879 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrlP06879 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PrlP06879 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrlP06879 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrlP06879 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrlP06879 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrlP06879 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrlP06879 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrlP06879 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrlP06879 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrlP06879 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrlP06879 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrlP06879 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrlP06879 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrlP06879 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrlP06879 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrlP06879 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrlP06879 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrlP06879 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrlP06879 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms